关于萧皇后的出身，《北史》和《隋书》都有记载。萧皇后的父亲萧岿。其父亲是梁朝著名的文学家、英年早逝的昭明太子萧统，所以萧岿自然顺理成章的继承了皇位，成为了西梁孝明帝，自然的萧氏也是公主。不过可悲的是，萧氏由于出生在二月，在当时的江南地区，二月出生的人实为不吉，于是，父母狠心的抛下她，把他交给他的叔叔萧岌抚养，所谓祸不单行，萧岌夫妇抚养萧氏没满一年就双双离世了。她又被转交给他的舅舅张轲抚养，而舅舅张轲家家境非常贫寒，甚至到了吃了上顿没有下顿的地步，萧氏虽然出生很好，但是完全没有富家小姐骄纵的脾气，反而还帮助舅舅操持家务。
隋文帝的次子杨广到了成婚的年纪。隋文帝与西梁向来交好，便决定从西梁选一位公主给杨广做妃。萧岿自然非常高兴，能与皇家攀上亲事，便积极介绍自己的三个女儿，不过可惜，都于杨广八字不合。这个时候才想起四女儿萧氏，便召了回来。萧氏跟随舅舅生活虽然很艰苦，但却被舅舅教育得很好，性情温婉，知书达理，隋文帝及孤独皇后和杨广都非常喜欢，最终被选为王妃。
萧氏本来就美艳动人，加上性格又好，后来更是生了一个儿子，隋文帝和孤独皇后对萧氏更是喜爱。杨广韬光养晦的手段更是千古少有，他装傻充愣，模仿父亲，取悦母亲，你俩讨厌什么，我就远离什么。所以隋文帝和孤独皇后对这个次子也是越来越喜欢。这样，杨广施展手段，加上萧后在后面支持，夫妻共同配合，杨广最终夺嫡，登上了皇位。
隋炀帝即位后，萧后虽已年过四十，但仍然对其宠爱有加。隋炀帝后期所做的事情有失纲常伦理，萧皇后虽多次劝谏却没有效果，最终隋朝灭亡。
江都之变隋炀帝遇害后，五十多岁的萧后带着幼孙和皇室诸女，先后流落于叛军宇文化及、窦建德处。
后来义成公主迎其至东突厥，流亡突厥的隋百姓奉炀帝孙杨政道为主，萧后与其居定襄。唐贞观四年李靖灭东突厥，萧后等才得以归长安，居长安城兴道里。
萧后于唐贞观二十一年去世，唐太宗以皇后礼将其与炀帝合葬扬州，谥曰愍。
